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研究在單細(xì)胞水平解析獼猴桃抗寒分子機(jī)制
[所屬分類:行業(yè)動(dòng)態(tài)] [發(fā)布時(shí)間:2025-10-10] [發(fā)布人:楊曉燕] [閱讀次數(shù):] [返回]
研究在單細(xì)胞水平解析獼猴桃抗寒分子機(jī)制
作者:李晨,趙倩 來源:中國科學(xué)報(bào)
山東拓普生物工程有限公司 http://521google.com.cn
近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所獼猴桃資源與育種團(tuán)隊(duì)在《園藝學(xué)前沿》(Horticulture Advances)上發(fā)表研究論文,首次在單細(xì)胞水平解析獼猴桃抗寒分子機(jī)制。
該研究通過scRNA-seq技術(shù)構(gòu)建首個(gè)獼猴桃葉片單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄圖譜,基于UMAP聚類、同源標(biāo)記基因與通路富集分析,成功鑒定8種細(xì)胞類型。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),保衛(wèi)細(xì)胞和葉肉細(xì)胞在不同抗寒基因型(HT和HY)間存在顯著差異。分析發(fā)現(xiàn)保衛(wèi)細(xì)胞和葉肉細(xì)胞具有不同的發(fā)育軌跡,是導(dǎo)致抗寒差異的原因。此外,研究還鑒定到一個(gè)抗寒性負(fù)調(diào)控基因AaTIFY,為基因編輯育種提供了新靶點(diǎn)。
該研究首次將單細(xì)胞RNA測序技術(shù)應(yīng)用于獼猴桃,在單細(xì)胞分辨率下揭示了不同抗寒基因型獼猴桃葉片細(xì)胞分化發(fā)育的異質(zhì)性,并挖掘出關(guān)鍵的抗寒負(fù)調(diào)控基因,為深入理解獼猴桃抗寒分子機(jī)制和分子育種提供了重要理論基礎(chǔ)和新基因資源。
獼猴桃資源與育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)副研究員林苗苗和碩士研究生張珍珍為論文共同第一作者,齊秀娟研究員為該論文通訊作者。方金豹研究員、李玉闊副研究員和團(tuán)隊(duì)其他成員參與本研究。該研究得到國家自然科學(xué)基金、國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程項(xiàng)目、中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)、中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)的資助。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1007/s44281-025-00077-4
(本文內(nèi)容來源于網(wǎng)絡(luò),版權(quán)歸原作者所有,如有侵權(quán)可后臺聯(lián)系刪除。)
作者:李晨,趙倩 來源:中國科學(xué)報(bào)
山東拓普生物工程有限公司 http://521google.com.cn
近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所獼猴桃資源與育種團(tuán)隊(duì)在《園藝學(xué)前沿》(Horticulture Advances)上發(fā)表研究論文,首次在單細(xì)胞水平解析獼猴桃抗寒分子機(jī)制。
該研究通過scRNA-seq技術(shù)構(gòu)建首個(gè)獼猴桃葉片單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄圖譜,基于UMAP聚類、同源標(biāo)記基因與通路富集分析,成功鑒定8種細(xì)胞類型。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),保衛(wèi)細(xì)胞和葉肉細(xì)胞在不同抗寒基因型(HT和HY)間存在顯著差異。分析發(fā)現(xiàn)保衛(wèi)細(xì)胞和葉肉細(xì)胞具有不同的發(fā)育軌跡,是導(dǎo)致抗寒差異的原因。此外,研究還鑒定到一個(gè)抗寒性負(fù)調(diào)控基因AaTIFY,為基因編輯育種提供了新靶點(diǎn)。
該研究首次將單細(xì)胞RNA測序技術(shù)應(yīng)用于獼猴桃,在單細(xì)胞分辨率下揭示了不同抗寒基因型獼猴桃葉片細(xì)胞分化發(fā)育的異質(zhì)性,并挖掘出關(guān)鍵的抗寒負(fù)調(diào)控基因,為深入理解獼猴桃抗寒分子機(jī)制和分子育種提供了重要理論基礎(chǔ)和新基因資源。
獼猴桃資源與育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)副研究員林苗苗和碩士研究生張珍珍為論文共同第一作者,齊秀娟研究員為該論文通訊作者。方金豹研究員、李玉闊副研究員和團(tuán)隊(duì)其他成員參與本研究。該研究得到國家自然科學(xué)基金、國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程項(xiàng)目、中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)、中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)的資助。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1007/s44281-025-00077-4
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