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新研究可有效預測胃癌腹膜轉移的標志物
[所屬分類:行業(yè)動態(tài)] [發(fā)布時間:2025-1-17] [發(fā)布人:楊曉燕] [閱讀次數(shù):] [返回]
新研究可有效預測胃癌腹膜轉移的標志物
作者:朱漢斌 來源:中國科學報
山東拓普生物工程有限公司 http://521google.com.cn
中山大學腫瘤防治中心胃外科副主任醫(yī)師李元方/聶潤聰團隊研究探索了長鏈非編碼RNA(lncRNA)在胃癌腹膜轉移中的轉錄景觀及其預測潛力,構建了基于lncRNA的胃癌腹膜復發(fā)預測系統(tǒng),并發(fā)現(xiàn)CASC15可通過激活JNK和p38信號通路促進胃癌細胞的遷移和侵襲,可作為胃癌腹膜轉移新的治療靶點。2024年12月31日,相關成果在線發(fā)表于《分子癌癥》(Molecular Cancer)。
胃癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,根據(jù)2022年我國癌癥研究中心報告,胃癌的發(fā)病率在惡性腫瘤中排名第5位,占所有新發(fā)惡性腫瘤的7.4%,胃癌相關死亡人數(shù)在惡性腫瘤中排名第3位,占總體腫瘤死亡人數(shù)的10.1%。由于早期胃癌缺乏典型癥狀,大部分患者在診斷時已經(jīng)處于進展期甚至出現(xiàn)遠處轉移。腹膜是胃癌遠處轉移及術后復發(fā)的常見部位,預后差,而且常規(guī)CT和PET/CT等方式診斷腹膜轉移的效果欠佳,漏診率達20-30%。因此,如何精準識別甚至預測胃癌腹膜轉移極具臨床意義。
為了解決這一臨床難題,研究團隊組建了涵蓋腫瘤外科、生物信息、基礎研究的多學科聯(lián)合攻關團隊,從胃癌腹膜轉移患者配對的胃癌原發(fā)灶、腹膜轉移灶以及正常胃黏膜上皮組織的lncRNA轉錄組譜入手,通過231例中山大學腫瘤防治中心胃癌患者數(shù)據(jù)與414例癌癥基因組圖譜(TCGA)胃癌患者數(shù)據(jù)雙隊列共同識別關鍵lncRNA,構建腹膜復發(fā)預測模型,并進一步通過體內(nèi)體外實驗驗證其背后的理論依據(jù)。
研究團隊通過LASSO回歸模型篩選出5個關鍵lncRNA(CASC15、CH17-360D5.2、LINC01094、MIR4435-2HG、RP11-400N13.3),并構建腹膜轉移評分,該評分可有效預測胃癌患者的無腹膜復發(fā)生存率、無復發(fā)生存率以及生存率。隨后,通過整合臨床病理信息,構建綜合評分模型,進一步提高了其對無腹膜復發(fā)生存率的預測效能,5年pRFS(無腹膜復發(fā)生存期)的AUC達0.79。
為了進一步探索該預測能力背后的機制,探索lncRNA在胃癌腹膜轉移的作用,研究團隊針對CASC15進行深入研究,通過體外和體內(nèi)多維度實驗驗證CASC15在胃癌腹膜轉移中的關鍵作用。此外,血漿的CASC15水平具備作為液體活檢標志物診斷胃癌腹膜轉移的潛力。機制研究表明,CASC15主要通過激活JNK和p38信號通路促進上皮間質(zhì)轉化和轉移。
該研究通過轉錄組分析和生物信息學方法,結合大樣本的臨床數(shù)據(jù),成功識別并驗證了與胃癌腹膜復發(fā)相關的關鍵lncRNA,首次構建了一個基于lncRNA的預測胃癌患者腹膜轉移復發(fā)風險模型,并為個體化治療提供了新的思路。
該研究還揭示了CASC15促進胃癌腹膜轉移的分子機制,并發(fā)現(xiàn)其作為液體活檢標記物的潛能,具有重要的臨床應用潛力。
相關論文信息:https://doi.org/10.1186/s12943-024-02196-4
(本文內(nèi)容來源于網(wǎng)絡,版權歸原作者所有,如有侵權可后臺聯(lián)系刪除。)
作者:朱漢斌 來源:中國科學報
山東拓普生物工程有限公司 http://521google.com.cn
中山大學腫瘤防治中心胃外科副主任醫(yī)師李元方/聶潤聰團隊研究探索了長鏈非編碼RNA(lncRNA)在胃癌腹膜轉移中的轉錄景觀及其預測潛力,構建了基于lncRNA的胃癌腹膜復發(fā)預測系統(tǒng),并發(fā)現(xiàn)CASC15可通過激活JNK和p38信號通路促進胃癌細胞的遷移和侵襲,可作為胃癌腹膜轉移新的治療靶點。2024年12月31日,相關成果在線發(fā)表于《分子癌癥》(Molecular Cancer)。
胃癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,根據(jù)2022年我國癌癥研究中心報告,胃癌的發(fā)病率在惡性腫瘤中排名第5位,占所有新發(fā)惡性腫瘤的7.4%,胃癌相關死亡人數(shù)在惡性腫瘤中排名第3位,占總體腫瘤死亡人數(shù)的10.1%。由于早期胃癌缺乏典型癥狀,大部分患者在診斷時已經(jīng)處于進展期甚至出現(xiàn)遠處轉移。腹膜是胃癌遠處轉移及術后復發(fā)的常見部位,預后差,而且常規(guī)CT和PET/CT等方式診斷腹膜轉移的效果欠佳,漏診率達20-30%。因此,如何精準識別甚至預測胃癌腹膜轉移極具臨床意義。
為了解決這一臨床難題,研究團隊組建了涵蓋腫瘤外科、生物信息、基礎研究的多學科聯(lián)合攻關團隊,從胃癌腹膜轉移患者配對的胃癌原發(fā)灶、腹膜轉移灶以及正常胃黏膜上皮組織的lncRNA轉錄組譜入手,通過231例中山大學腫瘤防治中心胃癌患者數(shù)據(jù)與414例癌癥基因組圖譜(TCGA)胃癌患者數(shù)據(jù)雙隊列共同識別關鍵lncRNA,構建腹膜復發(fā)預測模型,并進一步通過體內(nèi)體外實驗驗證其背后的理論依據(jù)。
研究團隊通過LASSO回歸模型篩選出5個關鍵lncRNA(CASC15、CH17-360D5.2、LINC01094、MIR4435-2HG、RP11-400N13.3),并構建腹膜轉移評分,該評分可有效預測胃癌患者的無腹膜復發(fā)生存率、無復發(fā)生存率以及生存率。隨后,通過整合臨床病理信息,構建綜合評分模型,進一步提高了其對無腹膜復發(fā)生存率的預測效能,5年pRFS(無腹膜復發(fā)生存期)的AUC達0.79。
為了進一步探索該預測能力背后的機制,探索lncRNA在胃癌腹膜轉移的作用,研究團隊針對CASC15進行深入研究,通過體外和體內(nèi)多維度實驗驗證CASC15在胃癌腹膜轉移中的關鍵作用。此外,血漿的CASC15水平具備作為液體活檢標志物診斷胃癌腹膜轉移的潛力。機制研究表明,CASC15主要通過激活JNK和p38信號通路促進上皮間質(zhì)轉化和轉移。
該研究通過轉錄組分析和生物信息學方法,結合大樣本的臨床數(shù)據(jù),成功識別并驗證了與胃癌腹膜復發(fā)相關的關鍵lncRNA,首次構建了一個基于lncRNA的預測胃癌患者腹膜轉移復發(fā)風險模型,并為個體化治療提供了新的思路。
該研究還揭示了CASC15促進胃癌腹膜轉移的分子機制,并發(fā)現(xiàn)其作為液體活檢標記物的潛能,具有重要的臨床應用潛力。
相關論文信息:https://doi.org/10.1186/s12943-024-02196-4
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